Le FC Bavois se compose actuelement des équipe suivantes :
- Première équipe (2ème ligue inter)
- Deuxième équipe (3ème ligue)
- Séniors (Champion)
- Juniors B (2ème degrès)
- Juniors D/7
- Juniors E
- Juniors F
Le FC Bavois fait partie du mouvement juniors « Groupement 2000″ aux côtés des clubs de Baulmes, Rances, Champvent, Ependes et Chavornay.
